Meld - инструмент визуального сравнения и слияния.
Beyond Compare позволяет сравнивать файлы и папки.
KDiff3 - это инструмент сравнения и слияния файлов и каталогов.
DiffMerge - это графическая программа сравнения файлов для Windows, Mac OS X и Unix, опубликованная SourceGear.
Merge - приложение для визуального сравнения файлов (сравнения).